Objectif : Identifier l’origine tissulaire des cancers de primitifs inconnus afin de pouvoir proposer un traitement ciblé au patient
Utilisateurs cibles : pathologistes et oncologues
Origine du projet
- Difficultés d’identification de l’origine tissulaire de certains cancers multi-métastatiques
- La connaissance de l’origine d’un cancer sert généralement de base à la mise en place du traitement
Nature de la solution
- Base d’apprentissage de 20 000 échantillons :
- 94 diagnostics différents
- 39 types de cancer
- Modèle d’auto-encodeur variationnel
- Réseau de neurones avec un nombre de couches paramétrable pour discriminer le tissu d’origine :
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- Temps de traitement de 15min
- Comparaison avec les résultats d’anatomo-pathologie et données cliniques
Modèle de diffusion
- Intégration à la RCP nationale CUP
- Intégration à venir à France Médecine Génomique pour étendre l’usage de la solution à tout le territoire
Modalité d’évaluation et de validation
- Test sur 50 tumeurs cancéreuses :
- 80% identifiées avec un score robuste
- 20% inclassées faute de références
- 30 patients via la RCP nationale, 100 patients à l’Institut Curie
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- Thèse en cours sur le traitement des patients suite à l’usage de l’outil
Perspectives
- Intégration à France Médecine Génomique pour la réalisation des RNAseq
- Encourager l’usage de la RCP nationale CUP
Contacts
Dr. Sarah Watson,
Médecin-chercheur oncologue et chef du projet
Institut Curie
Julien Vibert,
interne d’oncologie actuellement en thèse de sciences
Institut Curie